我國科學(xué)家成功繪制玉米高分辨三維基因組圖譜
新華社武漢6月16日電(記者李偉)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)科研團(tuán)隊(duì)近日成功繪制玉米活躍表達(dá)基因參與的高分辨率三維基因組圖譜,鑒定了基因組順式調(diào)控元件三維互作模式,揭示了玉米三維基因組結(jié)構(gòu)調(diào)控基因的表達(dá)進(jìn)而影響表型變異的潛在機(jī)理。系列成果表明,玉米高分辨率三維基因組的研究對于玉米功能基因組的研究,以及對于玉米復(fù)雜農(nóng)藝性狀的研究都有重要的意義。
記者16日從華中農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,該校李興旺教授、嚴(yán)建兵教授和李國亮教授團(tuán)隊(duì)合作的這一研究成果,近日在線發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《自然·通訊》。
玉米基因組中超過80%序列都位于基因間區(qū),其中包含許多已經(jīng)鑒定的影響重要農(nóng)藝形狀的遺傳變異,但是,玉米中這些位于基因間區(qū)的順式調(diào)控元件影響基因表達(dá)的機(jī)制尚不清楚。
三維基因組手段是破解遺傳機(jī)理的“關(guān)鍵鑰匙”,通過三維基因組的手段來解析玉米中順式調(diào)控元件的作用機(jī)制顯得尤為重要。而傳統(tǒng)三維結(jié)構(gòu)研究方法受限于精度不高等因素,很難得到高分辨率的三維結(jié)構(gòu)圖譜,制約了科學(xué)家對這一機(jī)制的破解。
來自華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生科院、植科院和信息學(xué)院的研究團(tuán)隊(duì)跨領(lǐng)域合作,利用創(chuàng)新的實(shí)驗(yàn)方法,產(chǎn)生了有關(guān)數(shù)據(jù),成功構(gòu)建了精確到基因水平的高分辨率玉米三維基因組結(jié)構(gòu)圖譜。
基于高分辨率的圖譜,研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步詳細(xì)展示了啟動子和啟動子交互基因的基本特征,同時(shí)研究人員提出三維空間的鄰近為基因的表達(dá)調(diào)控提供了基礎(chǔ)。
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